Pomimo tego, że krew pępowinowa ma wielu zwolenników, a jej pozytywne działanie zostało potwierdzone licznymi badaniami, to wciąż nie brakuje osób, które kwestionują zasadność pobierania krwi z pępowiny w trakcie porodu dziecka. Wielu z przeciwników tego działania twierdzi, że przechowywanie krwi dla swoich celów jest nieetycznym zachowaniem, kolejni zaś nie widzą plusów medycznych zastosowania tej krwi. Innego zdania są natomiast lekarze, którzy wielokrotnie w swojej karierze wykorzystywali komórki macierzyste zgromadzone w krwi do przeszczepów dla ludzi z nowotworami lub chorymi na białaczkę.